地球被新生物“血泥藻”蹂躏得通红。含有血泥藻的红雨降在世界各地，生物面临灭绝的危机。在只有被选中的人才能进入的“穹顶”中，因成绩优异而从贫民窟爬上来的橘瑞树开始探索被认为不可能治愈的疾病——RAIN的治疗方法。